Quand la Guerre Civile a fini, la conséquence de la conjoncture politique la plus importante pour La Chorale a été qu'elle n'a pas pu continuer avec le Théâtre Lyric Basque. Cependant, elle ne quitte pas la représentation des "zarzuelas".

Pendant les années 40, avec Arámbarri comme Chef du Choeur (qui était aussi le Chef de l'Orchestre Symphonique de Bilbao, BOS), La Chorale s'a consacré à la musique symphonique-chorale, en étrennent les oeuvres des compositeurs internationaux les plus importants en Espagne. Les grands débuts se sont alternés avec les cycles de Musique Sacre que la propre Société Chorale organisait. Ces cycles de Musique Sacre ont été l'axe des Pâques à Bilbao

Les étrennes continuent jusqu'au début des années 60, avec Rafael Frühbeck de Burgos comme Chef du Choeur. Le plus grand apogée est arrivé grâce à la présentation en Espagne, avec le permis exprès du propre compositeur, de l'oeuvre "Carmina Burana" de Carl Orff, qui a eu une grande resonance.

La Chorale a subi une étape en arrière quand Frühbeck de Burgos est parti à Madrid pour assumer la direction de l'Orchestre Nationale d'Espagne.